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绫波丽并不理解眼下安排的训练对自己有什么意义，她被要求和碇真嗣以及他们的同学们一起去参观海洋博物馆。
那里现在是由加持良治这个超级多面间谍负责，也是人类如今为数不多的还能够看到第二次冲击之前的海洋动物的地方。
血红色的海洋中，已经几乎没有任何生物了，而海洋生物博物馆中，则通过某些设备将海水重新还原成了原本蓝色的大海的样子，并且在其中养殖了许多几乎灭绝的野生动物。
参观这种地方，为了保证人类身上携带的病毒，细菌，并不会对这些野生动物造成影响，需要经历一次又一次的清洗，被泡在各种各样的消毒液之中，一群少年少女只穿着内衣在这样的环境之中坦诚相见。
一开始还有些羞涩，等到洗刷的多了，一个个全都是生无可恋的表情，等到最后换上了一身制服，终于可以参观这些海洋生物的时候，许多人脸上都是生无可恋的表情。
“大叔太狡猾了，明知道进这里需要经历那么多消毒步骤，竟然提前一步偷偷进来了！”明日香的气愤很快就被打消掉，因为她看到了曾经前所未见的动物，那现在海洋中游泳的热带鱼类，生活在原本的南极的企鹅，水下世界的色彩缤纷，完全超乎了她的想象，生活在这个年代的人，是几乎不可能见到这番光景的，不由得让人怀念大灭绝之前。
加持良治作为多面间谍和泡妞高手，长得帅又温柔的性格，顿时让明日香被深深吸引，就差沦为迷妹了。
TV版中，明日香就是加持良治的迷妹，看样子眼前这一次也是逃不掉了。
“在这里好几种生物能被你们看到，还要感谢这个自然物种修复基金会，人类在南极和北极都是有地球物种基因库建立的，因此许多灭绝的动物的基因还是保留着的。
但光有基因，没有母体，只有一些植物和卵生的动物比较容易复活过来，另外那些更为复杂的动物，以人类现有的技术手段是很难进行繁育的，而自然物种修复基金会就致力于这一点。
这里大半的动物都是他们帮忙修复的。”加持良治说着，还将相关的资料投影到屏幕之上，对这些东西，几个孩子并不是很感兴趣，只是想要去下一个场馆参观新的动物。
唯独碇真嗣在看到眼前的场景之后，略微皱起了眉头，他在那段有关于自然物种修复基金会的视频之中，看到了几个熟悉的身影，那些似乎都是蓝诺，虽然相貌上或多或少会有些区别，但神态和动作都很相似，特别是那些相貌差异很大的人，同样拥有相同的神态和动作，就比较不可思议了。
“嗯……大叔你也是克隆体吗？”碇真嗣突然开口询问，如今的他既然可以调查nerv，自然也可以调查蓝诺背后的组织。
