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唐朝建立后，孙思邈开始接受朝廷的邀请，与政府合作开展医学活动。
公元659年完成了世界上第一部国家药典《唐新本草》。公元682年孙思邈无疾而终。
《旧唐书》提到孙思邈“自注《老子》、《庄子》”，两书唐宋以来史志书目皆无著录，久已失传，故其关于道家思想的主张不得而知，唯蒙文通先生《晋唐老子古注四十家辑存》据赵秉文《老子集解》第六章“谷神不死”句，得孙思邈注佚文一条：“谷神，虚而灵者也”。
孙思邈是中华医学发展先河中一颗璀璨夺目的明珠，在中外医学史上留下不可磨灭的功勋，千余年来一直受到人们的高度评价和崇拜。唐太宗李世民赞孙思邈“凿开径路，名魁大医。羽翼三圣，调合四时。降龙伏虎，拯衰救危。巍巍堂堂，百代之师”。此颂元代勒石，当系后人附会之辞。
宋徽宗敕封孙思邈为“妙应真人”，被后世尊称为“药王”。
《千金要方》是我国最早的医学百科全书，从基础理论到临床各科，理、法、方、药齐备。一类是典籍资料，一类是民间单方验方。
